JA秋田厚生連の9つの病院は、それぞれ6つの基幹型臨床研修病院の協力型病院として、「たすきがけプログラム」を構成しております。これにより、所属する基幹型病院と希望に沿った他のグループ病院での研修と幅広く行うことができます。

また、秋田県と厚生連病院を含む県内14の臨床研修病院とで「秋田県臨床研修協議会」を組織しており、研修等を通じて交流を深める他、秋田県全体で安心して研修できる体制づくりをしております。